Quel Expert-Comptable pour Médecin en 2026 ?
Vous n’avez pas fait 10 ans d’études de médecine pour finir vos soirées à trier des facturettes de restaurant ou à déchiffrer le jargon de l’URSSAF.
Pourtant, une fois installé (ou même remplaçant), la réalité fiscale vous rattrape. Relevé SNIR qui ne colle pas, rétrocessions d’honoraires, passage en Secteur 2 (OPTAM)…
La comptabilité médicale est un champ de mines.
Jusqu’à récemment, vous aviez le choix entre payer cher un expert-comptable de quartier (souvent dépassé par les spécificités médicales) ou tout faire sur Excel (au risque du redressement).
Mais en 2026, deux géants se disputent le marché des médecins libéraux : Comptacool et Indy. Lequel choisir pour votre cabinet ?
Les 3 solutions sur le ring
Avant de comparer les leaders, comprenons les forces en présence.
A. L’Expert-Comptable « Classique » (Le Cabinet Physique)
C’est la solution historique. Vous déposez vos papiers, il s’occupe de tout.
- Le problème : C’est cher (souvent +1800€/an) et pas toujours réactif. S’il ne connaît pas les subtilités du Tiers Payant ou de la ROSP, il vous fera perdre de l’argent.
B. L’Expert-Comptable en Ligne (Ex: Comptacool)
C’est un vrai cabinet, inscrit à l’Ordre des Experts-Comptables, mais tout se passe à distance.
- La promesse : L’expertise humaine, la responsabilité du professionnel, mais avec des outils modernes et un prix plus doux.
C. Le Logiciel d’Automatisation (Ex: Indy)
Ce n’est pas un comptable, c’est un robot intelligent.
- La promesse : Il se connecte à votre compte bancaire, catégorise 90% des lignes tout seul, et génère votre 2035. C’est vous le patron, mais vous êtes guidé.
Zoom sur Comptacool : La référence « Humaine » 👨💼
Comptacool s’est imposé comme le chouchou des médecins qui veulent la paix de l’esprit.
Pourquoi ça marche ?
Parce que ce sont des spécialistes de la santé. Ils savent gérer le passage délicat du statut de « Remplaçant » à « Installé ». Ils connaissent les pièges de la CARMF et de l’URSSAF PAMC.
Le gros point fort :
C’est un Membre de l’Ordre. En cas de pépin ou d’erreur dans la déclaration, c’est leur assurance qui joue, pas la vôtre (sous réserve de conditions contractuelles, bien sûr). Ils vérifient votre SNIR manuellement.
Le prix :
Il faut compter environ 1200€ par an (souvent sous forme de forfait mensuel autour de 90-100€). C’est un budget, mais c’est le prix de la délégation totale.
Zoom sur Indy : La révolution « Automatique » 🤖
Indy (anciennement Georges), c’est le trublion qui a cassé les prix.
Pourquoi ça marche ?
L’interface est bluffante. On est loin de l’austérité comptable. C’est simple, coloré, et terriblement efficace. Le logiciel détecte automatiquement vos virements CPAM et vos rétrocessions.
Le gros point fort :
Le Pilotage. Vous voyez en temps réel combien vous gagnez, combien vous devez mettre de côté pour l’URSSAF. Plus besoin d’attendre le bilan en avril de l’année suivante pour savoir où vous en êtes.
Le prix :
Imbattable. À partir de 22€/mois (soit environ 264€/an) pour l’offre de base, ou un peu plus pour l’offre Premium avec accompagnement. C’est 3 à 4 fois moins cher qu’un comptable.
Le Match des Chiffres (Tableau Comparatif)
Voici ce que cela donne concrètement pour votre portefeuille et votre emploi du temps.
| Critères | 🤖 Indy (Logiciel) | 👨💼 Comptacool (Cabinet en Ligne) | 🏢 Expert Classique (Quartier) |
| Coût Annuel Moyen | ~264 € à 500 € | ~1 200 € | ~1 800 € ++ |
| Responsabilité | Vous (Assisté par le logiciel) | Expert-Comptable | Expert-Comptable |
| Temps à y passer | 2h / an (Validation) | 0h (Délégation) | 1h (RDV physique) |
| Gestion SNIR | Automatisée | Vérifiée par un humain | Variable |
| Visa Fiscal / ECF | Inclus (Offre Premium) | Souvent Inclus | Souvent en option (+200€) |
| L’atout majeur | Le Prix & L’App | La Sécurité | La Proximité |
Qui choisir entre Dougs, Comptacool, Indy pour un médecin ?
Le choix ne dépend pas de votre métier, mais de votre personnalité.
Choisissez Comptacool (ou Dougs) si…
- Vous angoissez à l’idée de faire une erreur fiscale.
- Vous avez une situation complexe (Secteur 2 avec gros dépassements, SPFPL, passage en SELARL).
- Vous êtes prêt à payer 100€/mois pour ne plus jamais entendre parler de compta. Et ca peut se comprendre !
Choisissez Indy si…
- Vous êtes Médecin Remplaçant, Collaborateur ou Installé en BNC « classique ».
- Vous voulez faire 1 000€ d’économie par an (de quoi vous payer un beau congrès ou des vacances).
- Vous aimez garder un œil sur votre trésorerie depuis votre smartphone.
Mon avis pour les médecins :
Pour 80% des médecins libéraux (surtout en début d’activité), l’expert-comptable humain est un luxe superflu.
En tout cas, ma petite soeur, médecin est sur Indy (lire l’article) ! 🙂
Les logiciels comme Indy sont désormais assez puissants pour gérer un cabinet médical sans risque.


